Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SP140Q13342 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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