Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 BMS1P8-201ENST00000565049 1178 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms