Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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