Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
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CCDC93Q567U6 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
CCDC93Q567U6 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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