Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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