Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms