Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms