Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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