Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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