Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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