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| BRD3 | Q15059 | AL023583.1-201 | ENST00000607518 | 1143 nt | BASIC | 6.95 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004241.2-201 | ENST00000614562 | 444 nt | BASIC | 6.95 | □□□□□ -1.3 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FP325318.1-201 | ENST00000616097 | 1263 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
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| BRD3 | Q15059 | PPP3CB-AS1-213 | ENST00000620302 | 501 nt | TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079298.2-201 | ENST00000623885 | 459 nt | BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL356094.1-201 | ENST00000624663 | 1212 nt | BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00836-201 | ENST00000625325 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC107398.4-201 | ENST00000635489 | 765 nt | TSL 2 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | CD96-202 | ENST00000352690 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | PDE4D-216 | ENST00000507116 | 3350 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AHNAK2-201 | ENST00000333244 | 18254 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | DNM1P47-202 | ENST00000561463 | 15043 nt | TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | DCN-218 | ENST00000551354 | 2924 nt | TSL 3 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | NBPF9-203 | ENST00000610300 | 2930 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF211-205 | ENST00000391703 | 2239 nt | TSL 2 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | CREM-217 | ENST00000439705 | 2306 nt | TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | KMO-202 | ENST00000366557 | 4888 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | CDY19P-201 | ENST00000411668 | 1613 nt | BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | CDY18P-201 | ENST00000438294 | 1609 nt | BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC9A6-212 | ENST00000637195 | 4858 nt | TSL 5 BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMC5-201 | ENST00000219821 | 3687 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.94 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | CHD2-215 | ENST00000628375 | 3202 nt | TSL 5 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | EEF1A1P16-201 | ENST00000325349 | 1414 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC098798.1-201 | ENST00000503998 | 1447 nt | TSL 5 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | BIRC3-207 | ENST00000615299 | 4342 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | TERB1-203 | ENST00000558713 | 2257 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPGRIP1-201 | ENST00000382933 | 2004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | PUS3-203 | ENST00000530811 | 1792 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | LACRT-201 | ENST00000257867 | 551 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | LDHC-201 | ENST00000280704 | 1256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR7D4-201 | ENST00000308682 | 1022 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP55-201 | ENST00000364888 | 307 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR10A4-201 | ENST00000379829 | 995 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL049697.3-201 | ENST00000406493 | 982 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP148-201 | ENST00000410179 | 275 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL663061.1-201 | ENST00000416625 | 580 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | VDAC1P10-201 | ENST00000416715 | 891 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL139042.1-201 | ENST00000429137 | 305 nt | TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC023128.1-201 | ENST00000432431 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | HNRNPA1P18-201 | ENST00000433537 | 927 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC01762-205 | ENST00000437308 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | FGF13-AS1-201 | ENST00000438238 | 849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC114814.1-201 | ENST00000444926 | 691 nt | TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL355483.3-201 | ENST00000446686 | 752 nt | TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009963.4-201 | ENST00000448535 | 339 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | NREP-207 | ENST00000450761 | 636 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPSAP48-201 | ENST00000466509 | 889 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SL379P-201 | ENST00000479912 | 293 nt | BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC013724.1-201 | ENST00000511962 | 783 nt | TSL 2 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF706-212 | ENST00000520984 | 782 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |
| BRD3 | Q15059 | C8orf44-205 | ENST00000521889 | 598 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 6.93 | □□□□□ -1.3 | | |