Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL1Q13616 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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