Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BPTFQ12830 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms