Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXA13P31271 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXA13P31271 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA13P31271 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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