Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
ERVV-1B6SEH8 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms