Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SH3BP1Q9Y3L3 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms