Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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