Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC107613.1-201ENST00000450488 1018 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TMEM97P1-201ENST00000452969 451 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 PGAM1P1-201ENST00000504014 556 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 EVX1-AS-201ENST00000517726 480 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 IGHVII-15-1-201ENST00000517931 220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 NPIPA2-201ENST00000529166 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AP001178.2-201ENST00000580007 326 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.30-201ENST00000621054 280 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MKRN4PQ13434 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DHFR2-206ENST00000619045 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ANKRD55-203ENST00000504958 2139 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AKNAD1-201ENST00000369994 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NAA16-201ENST00000379406 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 DDR2-201ENST00000367921 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MED7-201ENST00000286317 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CLUL1-203ENST00000540035 2199 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC112512.1-201ENST00000398957 1428 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 TTTY6B-201ENST00000253848 491 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RAET1E-201ENST00000357183 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 STPG3-202ENST00000412566 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 DNAJC9-AS1-202ENST00000457147 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 SLA-223ENST00000524345 1003 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AP001767.2-201ENST00000527291 382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC073896.5-201ENST00000546464 542 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC087798.1-201ENST00000547882 534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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MKRN4PQ13434 AC020908.1-201ENST00000598893 280 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 STPG3-205ENST00000620243 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.190-201ENST00000620330 287 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 AC093495.1-212ENST00000630173 1162 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
MKRN4PQ13434 LRRC37A3-211ENST00000584306 5665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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