Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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SP140Q13342 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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