Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFFO1Q0D2I5 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
IFFO1Q0D2I5 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms