Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LYPD6B-207ENST00000450639 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC140118.1-201ENST00000539209 532 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms