Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms