Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM78BQ5VT40 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms