Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN9O95484 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN9O95484 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN9O95484 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN9O95484 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN9O95484 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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