Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PDK4Q16654 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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