Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SS18Q15532 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms