Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms