Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PDS5BQ9NTI5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PDS5BQ9NTI5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms