Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Slc28a3Q9ERH8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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