Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms