Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pop5Q9DB28 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pop5Q9DB28 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pop5Q9DB28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms