Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc89Q9DA73 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc89Q9DA73 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms