Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab3bQ9CZT8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms