Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab5aQ9CQD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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