Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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