Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed9Q99KF1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms