Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EP400Q96L91 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EP400Q96L91 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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