Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cts3Q91ZD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cts3Q91ZD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms