Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebf4Q8K4J2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebf4Q8K4J2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms