Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd3Q8K1Y2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd3Q8K1Y2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms