Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rufy1Q8BIJ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy1Q8BIJ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms