Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx32Q80ZJ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx32Q80ZJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms