Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScocQ78YZ6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScocQ78YZ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms