Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc6aQ78XR0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms