Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim12Q78RX3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms