Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms