Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sprr1bQ62267 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms