Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf2Q59J78 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms