Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap9Q1HDU4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap9Q1HDU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms