Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CBFBQ13951 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms